لقد عملت   الكلية على قيام شراكات علمية قوية مع عديد من الجهات ، منها ما هو حكومي مثل مكتب الصحة العامة والسكان بساحل حضرموت  الذي تربطه بالكلية علاقات متينة تم من خلالها تنفيذ العديد من الأنشطة والبرامج المشتركة لما فيه مصلحة النظام الصحي. كما ترتبط الكلية بعلاقات وطيدة مع منظمة الصحة العالمية والتي قدمت عدداً من أوجه الدعم للعملية التعليمية ،كدعم المكتبة والمختبرات بالكلية ومساعدة أعضاء هيئة التدريس للمشاركة في المؤتمرات العلمية في الخارج .كما أن هناك اتفاقية شراكة مع المركز الوطني لمختبرات الصحة العامة المركزية  يتم من خلالها تأهيل كادر المركز مقابل استخدام المباني التابعة للمركز لتدريس وتدريب طلاب برنامج المختبرات الطبية بالكلية.